Para o efetivo cumprimento da sua missão e dos objetivos que lhe estão cometidos, os SAS/IPL organizam -se em duas Direções de Serviços que reportam ao responsável máximo e integram Setores de Atividades.
Com o objetivo de reforçar as estruturas de promoção da saúde mental e bem-estar no Politécnico de Lisboa, foram criados serviços de apoio psicológico e educativo, em cada uma das Escolas do IPL.